Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms