Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
LRRIQ1Q96JM4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
LRRIQ1Q96JM4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
LRRIQ1Q96JM4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
LRRIQ1Q96JM4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
LRRIQ1Q96JM4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
LRRIQ1Q96JM4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
LRRIQ1Q96JM4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
LRRIQ1Q96JM4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
LRRIQ1Q96JM4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
LRRIQ1Q96JM4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
LRRIQ1Q96JM4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
LRRIQ1Q96JM4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
LRRIQ1Q96JM4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
LRRIQ1Q96JM4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
LRRIQ1Q96JM4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
LRRIQ1Q96JM4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
LRRIQ1Q96JM4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
LRRIQ1Q96JM4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC33.65■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
LRRIQ1Q96JM4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
LRRIQ1Q96JM4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
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