Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
VPS50Q96JG6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VPS50Q96JG6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VPS50Q96JG6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VPS50Q96JG6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
VPS50Q96JG6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VPS50Q96JG6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS50Q96JG6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS50Q96JG6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS50Q96JG6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS50Q96JG6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS50Q96JG6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS50Q96JG6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS50Q96JG6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS50Q96JG6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS50Q96JG6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS50Q96JG6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS50Q96JG6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS50Q96JG6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS50Q96JG6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS50Q96JG6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS50Q96JG6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS50Q96JG6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS50Q96JG6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS50Q96JG6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VPS50Q96JG6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS50Q96JG6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS50Q96JG6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS50Q96JG6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS50Q96JG6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS50Q96JG6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS50Q96JG6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS50Q96JG6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS50Q96JG6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS50Q96JG6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS50Q96JG6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS50Q96JG6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS50Q96JG6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS50Q96JG6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS50Q96JG6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS50Q96JG6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS50Q96JG6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS50Q96JG6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS50Q96JG6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS50Q96JG6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS50Q96JG6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms