Protein–RNA interactions for Protein: Q96IQ7

VSIG2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG2Q96IQ7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VSIG2Q96IQ7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VSIG2Q96IQ7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VSIG2Q96IQ7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VSIG2Q96IQ7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VSIG2Q96IQ7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VSIG2Q96IQ7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms