Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX9

APIP, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APIPQ96GX9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APIPQ96GX9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APIPQ96GX9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms