Protein–RNA interactions for Protein: Q96GE6

CALML4, Calmodulin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML4Q96GE6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALML4Q96GE6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms