Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ELP4Q96EB1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELP4Q96EB1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms