Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RMDN1Q96DB5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RMDN1Q96DB5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RMDN1Q96DB5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RMDN1Q96DB5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RMDN1Q96DB5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RMDN1Q96DB5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RMDN1Q96DB5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RMDN1Q96DB5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RMDN1Q96DB5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RMDN1Q96DB5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RMDN1Q96DB5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RMDN1Q96DB5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RMDN1Q96DB5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RMDN1Q96DB5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RMDN1Q96DB5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RMDN1Q96DB5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RMDN1Q96DB5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RMDN1Q96DB5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RMDN1Q96DB5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RMDN1Q96DB5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RMDN1Q96DB5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RMDN1Q96DB5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RMDN1Q96DB5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RMDN1Q96DB5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RMDN1Q96DB5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RMDN1Q96DB5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RMDN1Q96DB5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RMDN1Q96DB5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RMDN1Q96DB5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RMDN1Q96DB5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RMDN1Q96DB5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RMDN1Q96DB5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms