Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RNF183Q96D59 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms