Protein–RNA interactions for Protein: Q96D15

RCN3, Reticulocalbin-3, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3Q96D15 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RCN3Q96D15 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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RCN3Q96D15 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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RCN3Q96D15 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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RCN3Q96D15 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
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RCN3Q96D15 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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RCN3Q96D15 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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RCN3Q96D15 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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RCN3Q96D15 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RCN3Q96D15 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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