Protein–RNA interactions for Protein: Q96C10

DHX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX58, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX58Q96C10 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DHX58Q96C10 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DHX58Q96C10 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms