Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ5

CCDC127, Coiled-coil domain-containing protein 127, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC127Q96BQ5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC127Q96BQ5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC127Q96BQ5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC127Q96BQ5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms