Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PRG4Q92954 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms