Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BRSK1Q8TDC3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRSK1Q8TDC3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms