Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BEST2Q8NFU1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BEST2Q8NFU1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BEST2Q8NFU1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BEST2Q8NFU1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BEST2Q8NFU1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BEST2Q8NFU1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BEST2Q8NFU1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BEST2Q8NFU1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BEST2Q8NFU1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BEST2Q8NFU1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BEST2Q8NFU1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BEST2Q8NFU1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BEST2Q8NFU1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms