Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM3Q8NE01 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNNM3Q8NE01 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms