Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM35BQ8NCS4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM35BQ8NCS4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms