Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBK3

SUMF1, Sulfatase-modifying factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMF1Q8NBK3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUMF1Q8NBK3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SUMF1Q8NBK3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SUMF1Q8NBK3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SUMF1Q8NBK3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SUMF1Q8NBK3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUMF1Q8NBK3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUMF1Q8NBK3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUMF1Q8NBK3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUMF1Q8NBK3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SUMF1Q8NBK3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SUMF1Q8NBK3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUMF1Q8NBK3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SUMF1Q8NBK3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUMF1Q8NBK3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUMF1Q8NBK3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUMF1Q8NBK3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SUMF1Q8NBK3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms