Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TMEM229BQ8NBD8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms