Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC63Q8NA47 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms