Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM71DQ8N9W8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM71DQ8N9W8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM71DQ8N9W8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM71DQ8N9W8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM71DQ8N9W8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM71DQ8N9W8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM71DQ8N9W8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM71DQ8N9W8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM71DQ8N9W8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM71DQ8N9W8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM71DQ8N9W8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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