Protein–RNA interactions for Protein: Q8N715

CCDC185, Coiled-coil domain-containing protein 185, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC185Q8N715 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC185Q8N715 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC185Q8N715 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms