Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN19Q8N6F1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN19Q8N6F1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
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