Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J5

PPM1K, Protein phosphatase 1K, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1KQ8N3J5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPM1KQ8N3J5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPM1KQ8N3J5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPM1KQ8N3J5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPM1KQ8N3J5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPM1KQ8N3J5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPM1KQ8N3J5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPM1KQ8N3J5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPM1KQ8N3J5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPM1KQ8N3J5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PPM1KQ8N3J5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PPM1KQ8N3J5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PPM1KQ8N3J5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPM1KQ8N3J5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPM1KQ8N3J5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPM1KQ8N3J5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPM1KQ8N3J5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPM1KQ8N3J5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPM1KQ8N3J5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPM1KQ8N3J5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPM1KQ8N3J5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPM1KQ8N3J5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPM1KQ8N3J5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPM1KQ8N3J5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPM1KQ8N3J5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPM1KQ8N3J5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPM1KQ8N3J5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPM1KQ8N3J5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPM1KQ8N3J5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPM1KQ8N3J5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPM1KQ8N3J5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PPM1KQ8N3J5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPM1KQ8N3J5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPM1KQ8N3J5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPM1KQ8N3J5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPM1KQ8N3J5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPM1KQ8N3J5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPM1KQ8N3J5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPM1KQ8N3J5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPM1KQ8N3J5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPM1KQ8N3J5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPM1KQ8N3J5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPM1KQ8N3J5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PPM1KQ8N3J5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPM1KQ8N3J5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPM1KQ8N3J5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PPM1KQ8N3J5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPM1KQ8N3J5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PPM1KQ8N3J5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms