Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LMNTD2Q8IXW0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LMNTD2Q8IXW0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms