Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT1

SCN4B, Sodium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4BQ8IWT1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN4BQ8IWT1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN4BQ8IWT1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms