Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU80

TMPRSS6, Transmembrane protease serine 6, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS6Q8IU80 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPRSS6Q8IU80 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPRSS6Q8IU80 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPRSS6Q8IU80 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPRSS6Q8IU80 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS6Q8IU80 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS6Q8IU80 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS6Q8IU80 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS6Q8IU80 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS6Q8IU80 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS6Q8IU80 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS6Q8IU80 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS6Q8IU80 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS6Q8IU80 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS6Q8IU80 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS6Q8IU80 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS6Q8IU80 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS6Q8IU80 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS6Q8IU80 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS6Q8IU80 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS6Q8IU80 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms