Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG4DQ86TL0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG4DQ86TL0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG4DQ86TL0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG4DQ86TL0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG4DQ86TL0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG4DQ86TL0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG4DQ86TL0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATG4DQ86TL0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms