Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLNKQ7Z7G1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLNKQ7Z7G1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms