Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z569

BRAP, BRCA1-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAPQ7Z569 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BRAPQ7Z569 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
BRAPQ7Z569 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRAPQ7Z569 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms