Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGC8

CHST3, Carbohydrate sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST3Q7LGC8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CHST3Q7LGC8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHST3Q7LGC8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms