Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HS2ST1Q7LGA3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms