Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SV2BQ7L1I2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms