Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SV2AQ7L0J3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms