Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SSH2Q76I76 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SSH2Q76I76 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SSH2Q76I76 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SSH2Q76I76 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SSH2Q76I76 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SSH2Q76I76 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SSH2Q76I76 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SSH2Q76I76 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SSH2Q76I76 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SSH2Q76I76 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SSH2Q76I76 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SSH2Q76I76 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SSH2Q76I76 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SSH2Q76I76 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SSH2Q76I76 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SSH2Q76I76 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SSH2Q76I76 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SSH2Q76I76 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SSH2Q76I76 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SSH2Q76I76 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SSH2Q76I76 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SSH2Q76I76 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SSH2Q76I76 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SSH2Q76I76 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SSH2Q76I76 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SSH2Q76I76 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SSH2Q76I76 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SSH2Q76I76 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SSH2Q76I76 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SSH2Q76I76 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SSH2Q76I76 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SSH2Q76I76 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SSH2Q76I76 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SSH2Q76I76 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SSH2Q76I76 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SSH2Q76I76 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SSH2Q76I76 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SSH2Q76I76 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SSH2Q76I76 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SSH2Q76I76 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SSH2Q76I76 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms