Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO3Q6UWJ1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
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