Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ZBED9Q6R2W3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZBED9Q6R2W3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms