Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAF7Q6Q0C0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF7Q6Q0C0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms