Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S1

DENND1B, DENN domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND1BQ6P3S1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND1BQ6P3S1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms