Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE9

LCN8, Epididymal-specific lipocalin-8, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN8Q6JVE9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCN8Q6JVE9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCN8Q6JVE9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCN8Q6JVE9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCN8Q6JVE9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LCN8Q6JVE9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCN8Q6JVE9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LCN8Q6JVE9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCN8Q6JVE9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCN8Q6JVE9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCN8Q6JVE9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCN8Q6JVE9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCN8Q6JVE9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LCN8Q6JVE9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LCN8Q6JVE9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LCN8Q6JVE9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LCN8Q6JVE9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LCN8Q6JVE9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LCN8Q6JVE9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LCN8Q6JVE9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LCN8Q6JVE9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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LCN8Q6JVE9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
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LCN8Q6JVE9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LCN8Q6JVE9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LCN8Q6JVE9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LCN8Q6JVE9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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LCN8Q6JVE9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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LCN8Q6JVE9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LCN8Q6JVE9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LCN8Q6JVE9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LCN8Q6JVE9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LCN8Q6JVE9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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LCN8Q6JVE9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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LCN8Q6JVE9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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LCN8Q6JVE9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LCN8Q6JVE9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LCN8Q6JVE9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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LCN8Q6JVE9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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LCN8Q6JVE9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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LCN8Q6JVE9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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LCN8Q6JVE9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LCN8Q6JVE9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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LCN8Q6JVE9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LCN8Q6JVE9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LCN8Q6JVE9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LCN8Q6JVE9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LCN8Q6JVE9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LCN8Q6JVE9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LCN8Q6JVE9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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LCN8Q6JVE9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCN8Q6JVE9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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LCN8Q6JVE9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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LCN8Q6JVE9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCN8Q6JVE9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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LCN8Q6JVE9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
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LCN8Q6JVE9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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LCN8Q6JVE9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCN8Q6JVE9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCN8Q6JVE9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCN8Q6JVE9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCN8Q6JVE9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCN8Q6JVE9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCN8Q6JVE9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LCN8Q6JVE9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LCN8Q6JVE9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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