Protein–RNA interactions for Protein: Q6GMV3

PTRHD1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTRHD1Q6GMV3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTRHD1Q6GMV3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTRHD1Q6GMV3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTRHD1Q6GMV3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTRHD1Q6GMV3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTRHD1Q6GMV3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTRHD1Q6GMV3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTRHD1Q6GMV3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTRHD1Q6GMV3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTRHD1Q6GMV3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTRHD1Q6GMV3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTRHD1Q6GMV3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PTRHD1Q6GMV3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTRHD1Q6GMV3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTRHD1Q6GMV3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTRHD1Q6GMV3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTRHD1Q6GMV3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTRHD1Q6GMV3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTRHD1Q6GMV3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTRHD1Q6GMV3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTRHD1Q6GMV3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTRHD1Q6GMV3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms