Protein–RNA interactions for Protein: Q6GMV2

SMYD5, SET and MYND domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD5Q6GMV2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD5Q6GMV2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD5Q6GMV2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD5Q6GMV2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD5Q6GMV2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD5Q6GMV2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD5Q6GMV2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD5Q6GMV2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD5Q6GMV2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMYD5Q6GMV2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMYD5Q6GMV2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMYD5Q6GMV2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMYD5Q6GMV2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMYD5Q6GMV2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMYD5Q6GMV2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMYD5Q6GMV2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMYD5Q6GMV2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMYD5Q6GMV2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMYD5Q6GMV2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMYD5Q6GMV2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms