Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC9A4Q6AI14 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC9A4Q6AI14 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms