Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms