Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC38Q5VT99 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC38Q5VT99 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms