Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYCP2LQ5T4T6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms