Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HIVEP3Q5T1R4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIVEP3Q5T1R4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms