Protein–RNA interactions for Protein: Q5JT25

RAB41, Ras-related protein Rab-41, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB41Q5JT25 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB41Q5JT25 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB41Q5JT25 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB41Q5JT25 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB41Q5JT25 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB41Q5JT25 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB41Q5JT25 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB41Q5JT25 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB41Q5JT25 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB41Q5JT25 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB41Q5JT25 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB41Q5JT25 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB41Q5JT25 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB41Q5JT25 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB41Q5JT25 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB41Q5JT25 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB41Q5JT25 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB41Q5JT25 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB41Q5JT25 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB41Q5JT25 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB41Q5JT25 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB41Q5JT25 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB41Q5JT25 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB41Q5JT25 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB41Q5JT25 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB41Q5JT25 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB41Q5JT25 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB41Q5JT25 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB41Q5JT25 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB41Q5JT25 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB41Q5JT25 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB41Q5JT25 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB41Q5JT25 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB41Q5JT25 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB41Q5JT25 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB41Q5JT25 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB41Q5JT25 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB41Q5JT25 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms