Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERC4Q5GLZ8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERC4Q5GLZ8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms