Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGO2Q562F6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGO2Q562F6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms